一、实验环境
洁净无 RNA 酶实验环境:
原理:环境中的 RNA 酶会迅速降解 RNA,导致提取的 RNA 质量下降甚至无法获得完整的 RNA。RNA 酶广泛存在于人的皮肤、唾液、灰尘等中,极微量的 RNA 酶就可能造成 RNA 的降解。
措施:使用专用的 RNA 提取实验室或在超净工作台中进行操作,实验台面用75%的酒精进行擦拭杀菌,最好用 RNase 去除剂擦拭,所用的移液器、离心管、吸头等耗材均为无 RNA 酶的产品或灭菌后的产品。个人需戴好口罩手套穿好实验服,避免个人的污染导致RNA提取失败。
仪器试剂提前预冷:
原理:低温状态下,会极大地抑制RNA 酶的活性,降低RNA提取过程的损失。
措施:离心机4℃预冷,所有的试剂(包括需要配置的试剂:75%乙醇等)置于4℃使用。
二、实验材料
样本新鲜:
原理:新鲜的样本中 RNA 完整性较好,随着样本存放时间的延长,RNA 会逐渐降解。
措施:尽量使用新鲜采集的样本进行 RNA 提取,若不能立即提取,可将样本保存在适当的条件下,如液氮或 -80℃冰箱中,以减缓 RNA 的降解速度;或者立即加入裂解液并且彻底而迅速地匀浆
选择合适的提取方法:
原理:不同的样本类型(如细胞、组织、血液等)需要采用不同的提取方法,以确保最大程度地提取出高质量的 RNA。
措施:对于细胞样本,可以使用 Trizol 法、试剂盒法等;对于组织样本,可能需要先进行匀浆处理再采用相应的提取方法;对于血液样本,有专门的血液 RNA 提取试剂盒。
三、实验操作
低温操作:
原理:低温可以降低 RNA 酶的活性,减少 RNA 的降解。
措施:在提取过程中,尽量在冰上操作,如样本的匀浆、离心等步骤,使用的试剂也可预先放在冰上冷却。
操作迅速:
原理:减少 RNA 暴露在可能含有 RNA 酶的环境中的时间,降低降解风险。
措施:熟悉实验流程,提前准备好所需的试剂和耗材,操作过程中尽量连贯、迅速。
避免剧烈振荡:
原理:剧烈振荡可能会导致 RNA 断裂,影响 RNA 的完整性。
措施:在混匀试剂和样本时,动作要轻柔,避免产生过多的气泡和剧烈振荡。
低温过夜沉淀:
原理:RNA 在特定的沉淀条件下(如加入异丙醇或乙醇等),会随着时间的推移逐渐沉淀下来。温度越低,沉淀的速度可能会相对减慢,但沉淀会更加充分。一些可能与 RNA 一起沉淀的小分子物质或部分蛋白质等杂质,在长时间的低温环境下,可能会保持溶解状态或者与 RNA 的结合力减弱,从而在后续的离心等操作中更容易被去除。
措施:低温过夜沉淀可以使杂质与 RNA 更好地分离,更加充分的沉淀可以增加RNA提取的量和纯度。
RNA分层后转移上清(Trizol法为例):
原理:一般加完氯仿后,提取液将分为三层,其中上清含有RNA,中层含有DNA和小肽等、下层含有蛋白、脂质、细胞或组织碎片等。若不小心取到中下层物质,提取的RNA纯度将有所下降。
措施:倾斜离心管,小心轻轻吸取上清溶液,尽量不要取到中层DNA等物质。
洗涤RNA后需充分风干洗液乙醇:
原理:乙醇会抑制后续的酶反应,如逆转录、PCR 等。如果有残留乙醇,可能会影响 RNA 的质量和下游实验的效果。
措施:可以选择在通风橱中快速风干离心管内残留的乙醇,或者将离心管倒扣于纸巾上晾至没有乙醇。
正确使用移液器:
原理:不准确的移液器操作可能会导致样本损失或污染,影响 RNA 的产量和质量。
措施:使用合适量程的移液器,确保吸取和排出液体时操作准确,避免产生气泡和液体残留。
四、实验后处理
RNA 的保存:
原理:合适的保存条件可以维持 RNA 的稳定性。
措施:应特别注意溶解RNA的溶液无RNA酶存在。提取的 RNA 可保存在 -80℃冰箱中,若需要长期保存,可加入适量的 RNA 稳定剂。避免反复冻融,以免 RNA 降解。
总之,提取 RNA 时需要从实验环境、实验材料、实验操作和实验后处理等多个方面严格控制,以确保获得高质量的 RNA。
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