判断RNA质量好坏的金标准

一、琼脂糖凝胶电泳（检测RNA的完整性）

RNA的完整性通常通过琼脂糖凝胶电泳来评估。

高质量的RNA在电泳图上通常显示为三条明显的带，分别是28S、18S和5S rRNA。一般来说，28S rRNA条带的亮度应为18S rRNA条带亮度的大约两倍，即28S:18S约为2-2.7:1是鉴定说明RNA具有完整性。

如果RNA呈现弥散状或条带不清晰，则表明RNA可能已降解。

如果10kb左右的亮带，带的深浅则可能表明DNA污染的严重程度。

如果点样孔发白，则可能表明有蛋白污染。

二、紫外分光光度计（检测RNA的纯度、浓度）

1.通过紫外分光光度计测量OD260值来评估RNA的浓度，核酸在260nm处有最大吸收峰。

根据朗伯-比尔定律，1个OD260值大约相当于40µg/ml的RNA浓度。

通过测量OD260/OD280值来评估RNA的纯度。蛋白在280nm处有最大吸收峰。

一般而言，

OD260/OD280值在1.8-2.1范围内表示RNA纯度较好。

如果OD260/OD280值低于1.8，可能表示有蛋白质或基因组的残留；

如果高于2.1，则可能表明RNA有部分降解。

2.盐离子和有机化合物在230nm有最大吸收峰

OD260/OD230值也可以用来评估RNA样品中盐离子、有机溶剂、碳水化合物等的污染。 但260/230的比值并不影响下游qPCR之类的实验，所以不用太担心。

三、RNA完整性数（RIN值）

RIN值是使用安捷伦2100生物分析仪获得的一个指标，用于评价RNA的完整性。

RIN值范围从1到10，数值越大，表示RNA完整性越好。在测序应用中，一般推荐RIN值大于7。

对于不同的生物样本，如原核生物、昆虫、软体动物、细菌和动物细胞系，RNA电泳图可能有不同的特征，需要根据具体情况进行评估。